Tutte le guerre combattute negli ultimi trent'anni sono state una farsa adibita a distrarre l’opinione pubblica da un’invasione aliena. Le nazioni della Terra combattono gli invasori alieni con creature con super-poteri dette Category D’s. Una di queste è Mana Eimiya, una ragazza che misura 49,46 metri d’altezza, il cui lavoro consiste nel combattere periodicamente gli alieni, a mani nude. Il problema è che si è innamorata di Makota Tobita, un ragazzo quaranta volte più piccolo di lei dai capelli a punta, ossessionato dalla cavalleria e iperprotettivo. Funzionerà questa strana relazione?