Arika Yumemiya è alla ricerca di sua madre, scomparsa in circostanze misteriose. L'unica preziosa informazione in grado di aiutare la ragazza è che la madre possedeva il prestigioso titolo di "Otome", il più alto grado tra i membri di un'élite - dotata di sofisticate tecnologie e di un particolare addestramento - incaricata di proteggere la Terra in seguito agli sconvolgimenti occorsi al pianeta. Arika perciò si reca nel reame di Wind Bloom, che ospita la prestigiosa accademia "Garderobe", dove numerose avventure attendono la ragazza e i suoi nuovi compagni, perché un nemico oscuro è sulle sue tracce e pare conoscere misteriosi dettagli del suo passato. Al Garderobe, Arika fa la conoscenza di Shizuru, una ammiratissima "Meister Otome" venerata quasi alla stregua di una dea. A quel punto, attratta dal carisma di costei, Arika scopre con chiarezza dentro di sé il sogno di diventare a sua volta una Otome...