L’armata degli Psycho Zaku, in mano ai membri dell’Alleanza dei Mari del Sud, si scontra di nuovo nel Settore Thunderbolt con l’Esercito Federale, guidato dal Perfect Zeong e dai due piloti Io e Lily. Grazie alla potenza dello Zeong e alla forza di coesione della Federazione, che ha giurato di vendicarsi dello Spartan, il combattimento termina con la disfatta dell’Alleanza. A quel punto, il teatro della battaglia si sposta su Side 6, un gruppo di colonie neutrali a cui Kaufman, Billy e gli altri chiedono che venga concesso asilo ai numerosi profughi...