Il suggerimento per trovare il punto della scuola elementare dov’è seppellita la capsula del tempo è forse contenuto in un codice segreto lasciato da Akemi Miyano? Conan s’impegna in una sfida per decifrarlo insieme all’amica Haibara e ai suoi compagni! Successivamente, in un famoso ristorante francese si sente un colpo d’arma da fuoco, Conan insegue il professore rapito davanti ai suoi occhi e appare una misteriosa “Dea del Vento”, di cui dovrà scoprire la vera identità. Poi si troverà ad affrontare Kaito Kid, intenzionato a rubare un prezioso tesoro, nonché Toru Amuro!