In un'Europa militaristica Leon é un soldato d'elite, imbarcato forzatamente per una missione segreta. Assieme ai suoi compagni di sventura dovrà recarsi in un Giappone in rovina, abbandonato da più di 200 anni, per recuperare un'arma potentissima il cui nome in codice é Tsugumi. La forza di quest'arma é tale che il mondo intero ha preferito distruggere l'arcipelago scagliando una pioggia di bombe atomiche piuttosto che vederla completata.
L'aereo su cui viaggia Leon si schianta e il soldato si trova solo a Tokyo Bay; affamato, allo stremo delle forze e con solo una tuta anti radioattiva ben presto scopre che la città non é deserta...