Il giovane Eito Akashi cade in preda allo sconforto dopo aver fallito l'esame di ammissione alle scuole superiori. A un certo punto però gli arriva la conferma di essere stato accettato da un liceo ove però non ricorda di avere fatto domanda. Più che ben contento di iniziare l'agognata vita delle superiori, scopre che il fantomatico istituto è in realtà una scuola che addestra i futuri agenti segreti.
Quando cerca di darsela a gambe, Eito è informato dal preside che anche il suo defunto padre era in realtà un agente segreto e così, cercando di scoprire il passato sul suo genitore, decide di rimanere nell'istituto anche a costo di sostenere i pericolosi test che lì si tengono.