Shinichi Kudo è un brillante liceale abilissimo nel risolvere qualunque enigma o caso di omicidio, anche il più complesso. Un giorno viene catturato da dei misteriosi uomini in nero e viene costretto a bere una strana medicina che lo trasforma in un bambino delle elementari… Da quel momento diverrà Conan, il piccolo detective più famoso del Giappone!
Il caso del cadavere scomparso in piscina viene finalmente risolto! L’ombra di Rum, il numero due dell’organizzazione degli Uomini in Nero, incombe su Conan e Haibara... Ma questo non impedisce al nostro infallibile detective di indagare su nuovi, misteriosi omicidi!